针对园艺作物种质资源、重要性状基因克隆、育种技术与品种选育、栽培生理与生长发育调控、采后及保鲜等开展相关研究，建设内容包括基础条件、人才队伍、协同创新机制、创新文化等。主要的学科建设方向如下：

 其一，果树蔬菜的种质创制及遗传改良研究，包括特色种质资源研究与创新；分子育种和细胞工程育种研究；新品种选育研究。

 其二，果树蔬菜的生物学研究，包括重要果蔬的生物信息学研究及利用；果树成花与果实发育研究。

 其三，亚热带果蔬产品采后生物学及保鲜技术研究，包括果蔬产品成熟衰老和品质劣变机理及控制技术；果蔬产品冷害的发生机理及控制技术；提高果蔬产品商品性和附加值的商品化处理技术。